Overview
분자 육종을 위한 기존의 qPCR, Microarray 기반의 유전자형 분석 기술의 한계를 극복하기 위해 GBS와 같은 NGS 기반의 High-throughput Genotyping 기술이 개발되어 비용 및 정확성 부분이 크게 향상되었습니다.
셀레믹스는 약 100-10,000개 가량의 SNP의 분석이 필요한 경우 사용하기 적합한 패널을 개발했습니다. 기존의 GBS로는 얻을 수 없었던 Restriction Enzyme site에 위치한 SNP 분석이 필요하거나 특정 SNP를 더 자세히 분석하고자 하는 경우 유용합니다.
Features &
Benefits
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- Target Enrichment Sequencing
- NGS를 기반으로 하기 때문에 기존 PCR, Microarray에 비해 정확도가 높아 효율적인 비용으로 유전자형 분석 가능
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- 정확도 높은 분석 결과 제공
- 100 – 10,000개 사이의 마커에 대해 False-negative, False-Positive가 낮은 정확도 높은 검사 결과를 제공하며 새로운 SNP 발굴 가능
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- 비용 효율적 분석
- High-throughput genotyping에 최적화된 Library preparation kit, Target capture, Multiplexing 기술을 통해 합리적인 비용에 좋은 품질의 분석 결과를 제공함
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- Origin을 고려한 패널 디자인
- 각 Origin에 특화된 Blocking oligo를 사용한 패널을 제작하며 이를 통해 원하는 Target 영역을 상세히 분석할 수 있음
Performance
낮은 빈도로 발생하는 유전변이 분석 및 새로운 유전자 마커 발굴 가능
- Hybridization 기반의 NGS Target Enrichment 기술은 Target 근처 영역까지 함한 새로운 SNP 발굴을 가능하게 합니다.
- 셀레믹스 Customized High-Throughput Genotyping 패널을 통해 고객은 원하는 Target 영역에서 발행한 유전자 마커를 발굴 할 수 있고 각 유전변이의 발생 빈도 역시 알 수 있습니다.
- 성공적인 유전체 지원 육종을 위해서는 작은 효과를 가진 QTL 또는 마커 손실을 방지하는 것이 중요합니다.
Large deletion, Gene Rearrangement을 포함한 구조적 변이 분석 가능
- Large deletion, Gene Rearrangement을 비롯한 모든 형태의 유전 변이의 정확한 분석 가능
- 고객은 Genome-estimated Breeding value 계산시에도 원하는 Large deletion, Gene rearrangement 정보를 포함하여 정확하게 계산할 수 있습니다.
- 또한 NGS-based high-throughput genotyping을 통해, 정확한 집단 간의 유전체 구조 변이 분석도 가능합니다.
Applications
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Genomics-assisted breeding
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Validation after gene editing