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NGS 용어 가이드 2편: 시퀀싱(Sequencing) NGS 용어 가이드 2편: 시퀀싱(Sequencing) NGS 실험의 성공은 정확하고 신뢰할 수 있는 시퀀싱 과정을 통해 완성됩니다. 이번 포스트에서는 SBS, SMRT, 나노포어 시퀀싱 등 핵심 시퀀싱 기술을 비롯해, 리드 길이, 페어드엔드 리드, 오류율, 베이스 콜링, 클러스터 생성과 같은 주요 개념들을 자세히 설명합니다. 이 용어 가이드를 통해 시퀀싱이 어떻게 작동하는지, 그리고 각 […]

병원체 유래 NGS 데이터 분석을 위한 통합 전략 병원체(Pathogen) 단순 검출을 넘어, 심층 분석이 필요한 이유? 병원체 분석에서 병원체의 존재 여부를 단순히 검사하는 데는 PCR이나 항원 검사와 같은 기존 검사법들이 더욱 신속하고 효과적입니다. 그러나 병원체의 특성, 변이 정보, 진화적 관계 등을 규명하고 이를 바탕으로 정확한 진단 및 치료, 그리고 병원체의 확산과 대응에 활용이 필요한 경우에는 […]

NGS 용어 가이드 1편: 샘플 준비 및 라이브러리 제작(Sample Preparation and Library Preparation) NGS 용어 가이드: 샘플 준비 및 라이브러리 제작 편 NGS 실험의 성패는 시퀀싱 전에 얼마나 잘 샘플을 준비하고, 라이브러리를 제대로 구성하느냐에 달려 있습니다. 이 글에서는 실험실에서 자주 접하는 핵심 개념과 용어들을 정리했습니다. 절단, 말단 수리, 어댑터 연결, 인덱싱부터 싱글가닥/이중가닥 프로토콜, 태그멘테이션, UMI까지 […]

MGI Library Preparation Method: Conversion from Illumina to MGI Celemics의 MGI 전환용 Library Preparation Method 차세대염기서열분석(NGS) 기술이 발전함에 따라 다양한 시퀀싱 플랫폼이 사용되고 있으며, Illumina와 MGI는 그 대표적인 예입니다. 그러나 두 플랫폼 간 호환성 부족은 연구자들에게 불편함과 시간 낭비를 초래하기도 합니다. Celemics는 이러한 문제를 해결하고자, 하나의 라이브러리 준비 및 타겟 농축 키트로 Illumina와 MGI 플랫폼을 […]

PDF Download [신제품 출시: 셀레믹스 효소 기반 롱리드 라이브러리 키트] Celemics Enzymatic NGS Library Preparation Kit for Oxford Nanopore Technologies 롱리드 시퀀싱(long-read sequencing)에 대한 수요가 점점 커지면서, 구조적 변이(structural variations), 반복 구간(repetitive regions), 복잡한 유전체(complex genomes) 분석 등에서 숏리드 기술(short-read technologies)의 한계를 극복하려는 연구가 활발해지고 있습니다. 셀레믹스는 이러한 흐름에 맞춰 Oxford Nanopore Technologies(ONT)에 최적화된 새로운 […]

Success Case: Development of a Comprehensive HIV-1 Panel HIV-1은 높은 돌연변이율과 유전적 다양성, 다양한 아형(subtype)과 재조합 형태(CRF)로 인해 기존의 표적 시퀀싱 방법으로 모든 변이형을 포괄적으로 검출하기 어렵습니다. 이러한 문제를 해결하기 위해 셀레믹스(Celemics)는 질병관리청(KDCA)과 협력하여 하이브리다이제이션 기반 HIV-1 타겟 인리치먼트(Target Enrichment) 패널을 개발했습니다. 이 캡처(Capture) 기반 접근법과 이에 연동된 바이오인포매틱스 분석 파이프라인(Bioinformatics Analysis Workflow)은 다양한 HIV-1 […]