셀레믹스 NGS Library의 Element Biosciences AVITI 호환성 검증: Illumina와의 성능 비교
최근 Illumina를 넘어 NGS 장비의 선택지는 다양해지고 있으며, 그 가운데 Element Biosciences의 AVITI는 독자적인 화학과 처리량으로 주목받고 있는 플랫폼입니다. AVITI는 자체 기술인 CloudBreak Freestyle을 통해 Illumina 호환 라이브러리를 그대로 받아들여 시퀀싱할 수 있도록 설계되어 있습니다.
플랫폼 간 시퀀싱 성능 비교 검증
셀레믹스에서 이번 검증을 통해 실제로 확인하고자 한 것은, 단순히 시퀀싱이 가능한지 여부가 아니라 셀레믹스의 라이브러리 프렙 키트와 캡처 패널로 만든 라이브러리가 AVITI에서 처리되었을 때 Illumina에서 얻던 것과 동등한 수준의 데이터 품질을 보여주는지였습니다.
아무리 플랫폼 간 호환이 가능하다 해도, mapping rate나 on-target ratio, 커버리지 균일도 같은 실질적인 성능 지표가 떨어진다면 실무에서 쓰기 어렵기 때문입니다. 이를 확인하기 위해 셀레믹스의 커스텀 캡처 패널 두 종(Panel A, Panel B)으로 제작한 라이브러리를 Illumina NextSeq 500과 Element Biosciences AVITI에 동일하게 로딩해 시퀀싱하고, 동일한 분석 파이프라인으로 결과를 비교했습니다.
AVITI와 Illumina에서 확인된 유사한 시퀀싱 성능
그 결과, mapping rate, duplication rate, on-target ratio, Fold-80 base penalty, 목표 커버리지 도달률까지 두 패널 모두에서 플랫폼 간 차이가 크지 않았습니다. 이는 셀레믹스의 키트로 만든 라이브러리가 AVITI에서 처리되어도 Illumina에서와 견줄 만한 데이터 품질을 유지한다는 것을 보여주는 결과이며, 즉 성능 저하에 대한 우려 없이 AVITI 환경에서도 문제없이 사용할 수 있다는 뜻입니다.
Figure 1. Illumina와 Element Biosciences AVITI 간 Panel A, Panel B 시퀀싱 지표 비교. Duplication rate, on-target ratio, Fold-80 base penalty가 두 플랫폼에서 유사하게 나타났으며, 여러 커버리지 깊이(1X~100X)에서도 두 패널 모두 비슷한 수준을 보였습니다.
하나의 Library Prep Workflow로 넓어지는 시퀀싱 플랫폼 선택지
이번 결과는 셀레믹스의 라이브러리 프렙 키트와 캡처 패널이 Illumina에서 검증된 성능을 AVITI로도 그대로 이어갈 수 있음을 확인시켜 줍니다. 기존 프렙 워크플로우를 바꾸지 않으면서 시퀀싱 플랫폼의 선택지를 넓히고 싶은 고객이라면, 데이터 품질에 대한 걱정 없이 AVITI를 옵션에 추가할 수 있습니다.
이는 실제 운영 관점에서도 실질적인 이점으로 이어집니다. Illumina와 AVITI 두 장비를 함께 운용하는 랩이라면, 플랫폼별로 별도의 키트를 구비할 필요 없이 하나의 키트 재고만으로 두 시퀀서를 모두 대응할 수 있어 재고 관리 부담이 줄어듭니다. 또한 새로운 프로토콜을 익히거나 실험 조건을 다시 최적화하는 과정 없이, 기존에 사용하던 프렙 절차 그대로 AVITI 런에 바로 적용할 수 있다는 점도 도입 문턱을 낮추는 요소입니다.
세부 지표와 데이터는 셀레믹스의 Application Note 문서에서 확인하실 수 있습니다.
Application Note에서 자세한 결과를 확인해 보세요
Element Biosciences AVITI와 Illumina NextSeq 500에서 확인한 Celemics Library의 상세 시퀀싱 지표와 성능 비교 결과를 Application Note에서 확인하실 수 있습니다. Celemics Library Preparation Kit 및 Capture Panel의 AVITI 적용에 대해 궁금한 점이 있으신가요?
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