NGS(Next-Generation Sequencing) 장비는 유전체의 염기서열을 고속으로 분석하는 기술로, 이 과정에서 DNA 샘플을 작은 조각으로 자르고, 양 끝에 공통적인 프라이머 결합 부위를 부착하는 것이 필수적입니다. 이러한 준비 과정을 NGS 라이브러리 제작(NGS library preparation)이라고 하며, 프라이머 결합 부위는 NGS 어댑터(NGS adapter)라고 부릅니다.
NGS 어댑터는 DNA 조각의 양 끝에 부착되며, 시퀀싱 과정에서 중요한 역할을 합니다. 어댑터는 시퀀싱 반응 동안 프라이머가 결합할 수 있는 부위를 제공하여, DNA 조각이 시퀀싱 장비에서 인식되고 증폭될 수 있도록 돕습니다. 각 시퀀싱 플랫폼은 서로 다른 형태의 프라이머를 사용하기 때문에, 각 플랫폼에 맞는 어댑터 서열을 사용하는 것이 필수적입니다. 이러한 장비에 맞는 시약 구성과 어댑터 서열을 이용하여 NGS 라이브러리를 제작하는 방식을 Native NGS 라이브러리 제작 방식이라고 하며, NGS 실험을 수행할 때 가장 일반적으로 사용하는 방식입니다
Native NGS 라이브러리 제작 방식 외에도 다른 시퀀싱 플랫폼을 이용할 수 있는 방법이 존재합니다. 예를 들어, 다른 시퀀싱 플랫폼을 위한 NGS 라이브러리 제작 키트를 이용하여 라이브러리를 만든 후, PCR 과정을 통해 어댑터 서열을 변경하거나 추가하여 원하는 시퀀싱 플랫폼에 적합한 형태로 전환하는 방식이 있습니다. 이 방식을 NGS 라이브러리 전환 (NGS library conversion)이라고 부릅니다. 유전자 포획 키트(Target enrichment kit)을 사용하는 경우, Post-PCR 단계를 NGS library conversion 단계의 PCR로 대체할 수 있습니다. 이 경우 실험 과정이 복잡해지지 않으면서도 추가적인 증폭이 없으므로 성능 저하를 방지할 수 있습니다.
NGS 라이브러리 변환 키트의 장점은 실험 조건이나 사용하는 시약의 변경 없이 기존에 사용하던 NGS 라이브러리 제작 키트를 그대로 사용할 수 있다는 점입니다. 또한, 여러 시퀀싱 플랫폼을 동시에 사용하는 경우, 한 종류의 플랫폼에 대한 라이브러리 제작 키트만 보유하면 되므로 제품 재고 관리 측면에서도 유리합니다. 동일한 실험을 서로 다른 시퀀싱 플랫폼에서 진행하여 성능을 비교할 때, 직전 단계에서 샘플을 분할해 적용하면 초기 샘플 조건, 라이브러리 제작, 유전자 포획 등 전체 실험 과정을 완벽하게 동일한 상태에서 비교할 수 있다는 점도 중요한 이점입니다.