Substituting Key Instruments in NGS Library Preparation & Target Enrichment
NGS 실험에서 Library Preparation 및 Target Enrichment 과정은 여러 필수 장비를 필요로 합니다. 이러한 장비들은 실험의 정확성과 효율성을 높이는 데 중요한 역할을 합니다.
이번 포스트에서는 CELEMICS의 Library Preparation 및 Target Enrichment 키트 사용 시 필요한 주요 장비와 함께, 해당 장비를 사용할 수 없는 경우 고려할 수 있는 대체 옵션을 소개합니다.
대체 가능한 장비 목록
| 구분 | 장비 | 대체 가능 여부 |
|---|---|---|
| 1 | TapeStation Instrument | O |
| 2 | Vacuum Concentrator | O |
| 3 | 1.5 mL Tube Rotator | O |
| 4 | Heat Block | △ |
- TapeStation Instrument
DNA 라이브러리의 크기와 농도는 NGS 실험에서 매우 중요한 요소입니다. TapeStation 시스템은 한 번의 반응으로 두 가지 정보를 모두 제공하는 장점이 있습니다. 하지만 TapeStation을 사용할 수 없는 경우, 크기와 농도를 별도로 측정해야 합니다. 대체 방법으로는 다음과 같은 옵션이 있습니다.
- Bioanalyzer – TapeStation과 유사한 기능을 하는 장비로 라이브러리의 크기와 농도를 동시에 측정 가능
- Qubit and Agarose Gel – Qubit 장비로 라이브러리의 농도를 측정하고 Agarose gel로 크기 측정 가능
- Vacuum Concentrator
Vacuum Concentrator는 Target Enrichment 과정에서 필수인 과정입니다. 하지만 셀레믹스는 본 장비가 없는 고객들을 위해 자사의 CeleMag™ Clean-up Bead를 이용한 대체 프로토콜을 제공해드릴 수 있습니다. - 1.5 mL Tube Rotator
1.5 mL Tube Rotator는 Hybridization Washing 과정 중 필요한 장비로 CeleMag Streptavidin™ Bead와 Target Enrichment Mixture를 부드럽게 섞어줄 때 사용합니다. 만약 이 장비를 보유하지 않고 있다면 Rocker나 매우 부드러운 강도의 Vortex Mixer를 사용할 수 있습니다. - Heat Block
Hybridization Washing 단계에서는 Heat Block이 필수적입니다. 일부 고객은 96-well plate을 사용하여 실험하는 경우가 있습니다.
이러한 경우, Thermal Cycler (PCR 기기)를 Heat Block의 대체 장비로 사용할 수 있습니다.
| 구분 | 장비 | 대체 장비 |
|---|---|---|
| 1 | TapeStation Instrument | Bioanalyzer, Qubit + Agarose Gel |
| 2 | Vacuum Concentrator | CeleMag™ Clean-up Bead |
| 3 | 1.5 mL Tube Rotator | Rocker, Vortex Mixer |
| 4 | Heat Block | Thermal Cycler |
이번 포스트에서는 NGS 실험에서 Library Preparation 및 Target Enrichment 과정에 필요한 주요 장비와 대체 가능한 옵션들을 소개했습니다. 더 자세한 정보나 CELEMICS의 다양한 제품 포트폴리오에 대해 알고 싶다면 support@celemics.com으로 문의해 주세요.
