셀레믹스의 새로운 병원체 분석 플랫폼 ‘CAS Pathogen’
Sequencing은 쉬워졌지만 분석은 여전히 어렵다
병원체 NGS 분석에서 가장 큰 장벽은 시퀀싱 그 자체가 아니라 그 이후의 데이터 분석입니다. 최근에는 시퀀싱 기술과 Target Enrichment 기술의 발전으로 병원체 유전체 데이터를 생성하는 것이 과거보다 훨씬 쉬워졌지만, 생성된 데이터를 해석하고 활용 가능한 결과로 전환하는 과정은 여전히 많은 연구실과 기관의 부담으로 남아 있습니다.
FASTQ 파일을 생성한 이후에도 QC(Quality Control), Alignment, Variant Calling, Consensus Sequence 생성, 결과 시각화 및 보고서 작성까지 여러 단계가 필요합니다. 이러한 과정은 Bioinformatics 전문 인력과 분석 환경을 요구하는 경우가 많아, 병원체 NGS 도입의 주요 장벽으로 작용하기도 합니다.
셀레믹스는 이러한 문제를 해결하기 위해 새로운 클라우드 기반 병원체 분석 플랫폼 CAS Pathogen을 제공합니다. CAS Pathogen은 셀레믹스의 분석 솔루션 브랜드인 CAS(Celemics Analysis Service)의 병원체 분석 특화 플랫폼으로, FASTQ 파일 업로드만으로 QC, Alignment, Variant Calling, Consensus Sequence 생성까지 자동 수행하며 결과를 직관적인 시각화와 PDF 리포트 형태로 제공합니다.
왜 병원체 분석 플랫폼이 필요한가?
COVID-19 팬데믹 이후 감염병 감시(Pathogen Surveillance)는 일부 레퍼런스 연구소만의 영역이 아니라 공중보건 기관, 병원, 연구기관 전반으로 확대되었습니다. 특히 호흡기 감염, 출혈열, 발진성 발열과 같은 다양한 증후군(Syndrome)에 대해 신속하고 정확한 원인 병원체 규명이 요구되고 있으며, 이를 위한 병원체 유전체 분석 수요도 지속적으로 증가하고 있습니다.
NGS 기반 Target Enrichment 기술은 바이러스, 세균, 진균을 동시에 분석할 수 있으며, 새로운 변이까지 유전체 수준에서 추적할 수 있어 병원체 감시와 연구에 강력한 도구로 활용되고 있습니다.
그러나 실제 현장에서의 가장 큰 어려움은 시퀀싱이 아니라 데이터 분석입니다.
CAS Pathogen은 바로 이러한 분석 Workflow의 복잡성을 줄이고, 병원체 NGS 데이터 활용의 진입장벽을 낮추기 위해 설계되었습니다.
FASTQ 파일을 어떤 파이프라인으로 분석해야 할까?
QC, Alignment, Variant Calling, Consensus Sequence 생성을 직접 수행해야 할까?
분석 결과를 임상의, 역학조사관, 정책결정자가 이해할 수 있는 형태로 어떻게 제공할 수 있을까?
CAS Pathogen: FASTQ에서 리포트까지 자동화
- 완전 자동화된 분석 파이프라인
CAS Pathogen은 QC부터 Alignment, Variant Calling, Consensus Sequence 생성까지 전 과정을 자동화합니다. 사용자는 FASTQ 파일만 업로드하면 되며, 별도의 명령어 입력이나 분석 파이프라인 구축 없이 표준화된 결과를 얻을 수 있습니다.
- 직관적인 데이터 시각화
CAS Pathogen은 Coverage Depth, Read Distribution, Variant Analysis 결과를 직관적인 차트와 시각화 형태로 제공합니다.
Bioinformatics 전문가가 아니더라도 결과를 쉽게 이해할 수 있도록 설계되어 있으며, 데이터 기반 의사결정을 보다 빠르게 지원합니다.
- 종합 리포트 자동 생성
분석 결과는 PDF 형태의 종합 리포트로 자동 생성됩니다.
생성된 리포트는 연구 보고서, 공중보건 감시 자료, 논문 작성, 역학조사 보고서 등에 바로 활용할 수 있으며, 별도의 데이터 정리 과정을 최소화합니다.
- 클라우드 기반 접근성
CAS Pathogen은 별도의 고사양 서버나 로컬 설치 환경이 필요하지 않습니다.
웹 브라우저만 있으면 언제 어디서나 안전하게 분석을 수행할 수 있으며, 기관 규모와 관계없이 손쉽게 병원체 분석 환경을 구축할 수 있습니다.
Sample to Insight: An End-to-End Workflow
CAS Pathogen은 독립적인 분석 플랫폼으로도 사용할 수 있지만, 셀레믹스의 Target Enrichment 솔루션과 결합할 때 더욱 큰 가치를 제공합니다.시약, 시퀀싱, 분석까지 전 과정이 사전 검증된 통합 Workflow로 연결되어 Sample-to-Insight 과정을 단순화할 수 있습니다
- Hybridization Capture Workflow
Hybridization Capture 방식은 광범위한 병원체 탐색과 Whole-Genome 수준의 균일한 Coverage 확보가 필요한 연구에 적합합니다.
- Amplicon Sequencing Workflow
Amplicon 기반 방식은 미량(Low-amount) 샘플의 신속한 분석과 특정 병원체의 고처리량 분석에 적합합니다.
- 워크플로우와 관계없이 일관된 분석 경험
어떤 Target Enrichment 방식을 선택하더라도 이후의 분석 단계는 CAS Pathogen이 동일한 사용자 경험으로 처리합니다.
각 단계는 셀레믹스의 검증된 시약 키트와 프로토콜로 표준화되어 있으며, 최종 분석은 CAS Pathogen이 수행함으로 샘플 수령부터 리포트 생성까지의 Hands-on Time을 크게 줄일 수 있습니다.
증후군 기반 패널과의 완벽한 연동
CAS Pathogen은 셀레믹스의 증후군 기반(Syndrome-Driven) 패널과 사전 통합되어 있습니다.
사용자는 패널을 선택하기만 하면 해당 패널에 최적화된 Reference Database와 Variant Analysis Logic이 자동 적용되어 보다 효율적인 분석을 수행할 수 있습니다.
Syndromic Panels — 임상 증상 기반 통합 검출
환자의 임상 증상을 기반으로 해당 증상을 유발할 수 있는 다양한 병원체를 단일 검사로 분석할 수 있습니다
Infectious Respiratory Syndrome Panel
호흡기 감염과 관련된 주요 병원체를 동시에 검출할 수 있습니다.- Hemorrhagic Fever Syndrome Panel
출혈열을 유발하는 주요 병원체를 분석할 수 있습니다.
- Rash with Fever Syndrome Panel
발진과 발열을 동반하는 감염성 질환의 원인 병원체를 탐지할 수 있습니다.
Targeted Panels — 특정 병원체 그룹 정밀 분석
특정 병원체 그룹에 대해 보다 깊이 있는 시퀀싱 정보가 필요한 경우 사용할 수 있는 패널입니다.
Pathogen Amplicon Panel
Influenza A/B, RSV, HMPV 등 주요 호흡기 바이러스의 Amplicon Sequencing 분석을 지원합니다.- Biological Agent Detection Panel
생물학적 위협 인자(Biological Threat Agent) 감시를 위한 특화 패널입니다.
주요 NGS 플랫폼과 호환
CAS Pathogen은 특정 시퀀서에 종속되지 않습니다. Illumina, Thermo Fisher (Ion Torrent), MGI 등 주요 NGS 플랫폼에서 생성된 데이터를 모두 처리할 수 있어, 기존 시퀀싱 인프라를 그대로 활용하면서 분석 워크플로우만 표준화할 수 있습니다.
Pathogen Surveillance를 위한 분석 Workflow의 표준화
병원체 유전체 분석의 가치는 단순히 시퀀싱 데이터를 생산하는 데 있지 않습니다. 생성된 데이터를 얼마나 빠르고 일관되게 해석하여 실제의사결정에 활용할 수 있는지가 더욱 중요합니다. 특히 공중보건 감시(Pathogen Surveillance)와 Outbreak Investigation 환경에서는 기관마다 다른 분석 파이프라인을 사용하는 경우 결과 비교와 해석에 어려움이 발생할 수 있습니다. CAS Pathogen은 FASTQ 업로드부터 분석, 시각화, 리포트 생성까지의 전 과정을 표준화하여 병원체 유전체 분석의 접근성을 높이고, 보다 효율적인 감염병 연구와 감시 체계를 지원합니다.
[CAS Pathogen이 필요한 사용자 및 기관]
- 공중보건 연구소 및 감염병 감시 기관
- 병원 감염내과 및 진단검사의학과
- 수의·환경·식품 분야 연구자
- One Health 연구 수행 기관
- Bioinformatics 전문 인력이 부족한 연구실
어떤 결과가 나오는지 미리 확인해보세요
병원체 NGS 분석의 가치는 단순히 데이터를 생성하는 데 있지 않습니다. 생성된 데이터를 얼마나 빠르고 이해하기 쉬운 형태로 제공할 수 있는지가 실제 활용도를 결정합니다.
CAS Pathogen은 Coverage Depth, Read Distribution, Variant Analysis, Consensus Sequence 정보를 직관적인 시각화와 함께 제공하며, 결과를 PDF 리포트 형태로 자동 생성합니다.
실제 분석 결과 예시 페이지에서 CAS Pathogen의 사용자 인터페이스와 리포트 구성을 직접 확인해 보세요.
CAS Pathogen 알아보기
CAS Pathogen은 FASTQ 업로드부터 QC, Alignment, Variant Analysis, Consensus Sequence 생성, 시각화 및 PDF 리포트까지 자동화된 병원체 분석 환경을 제공합니다. 공중보건 감시, 임상 연구, One Health 연구를 위한 표준화된 Pathogen Genomics Workflow를 경험해 보세요.
