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NGS를 활용한 AgBio 연구: 비용 효율적이고 정확한 타겟 시퀀싱

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AgBio Research with NGS: Cost-Effective and Accurate Target Sequencing

차세대 염기서열 분석(NGS) 기술은 빠르고 효율적으로 대량의 염기 서열을 분석할 수 있어 생물학의 다양한 분야에서 널리 활용되고 있습니다. 농업 생명공학(AgBio) 분야에서도 NGS는 동식물 품종 개량, 유전형 기반 형질 연구, 병원체 분석, 미생물 군집 연구 등 다양한 목적으로 활용되고 있습니다. 특히 AgBio 연구는 대량의 샘플을 처리해야 하는 경우가 많아 비용 효율성이 중요한 과제 중 하나입니다. 이러한 점에서, 특정 유전자나 유전체 영역을 집중적으로 분석할 수 있는 타겟 시퀀싱은 AgBio 분야에서 효과적이고 경제적인 도구로 주목받고 있습니다. 셀레믹스는 다양한 타겟 포획 패널 개발 경험을 바탕으로 AgBio 패널 제품을 제공하고 있습니다.

타겟 포획 키트에서 블로커(Blocker)는 NGS의 정확도와 효율성을 높이기 위해 중요한 역할을 합니다. 블로커를 사용하지 않거나 성능이 미흡한 경우, 시퀀싱 데이터의 On-target 비율이 감소하게 되며, 이는 동일한 수준의 분석 결과를 얻기 위해 더 많은 시퀀싱 데이터를 생성해야 한다는 것을 의미합니다. 그 결과, 분석에 소요되는 비용도 증가하게 됩니다. 셀레믹스는 최적의 분석 성능을 보장하기 위해 타겟 포획 키트에 사용되는 시퀀서(Sequencing Platform) 및 종 특이적 블로커를 직접 제작하고 있습니다.

분자 육종은 유전적 정보를 기반으로 유리한 형질을 선택적으로 개선하고, 새로운 품종을 개발하는 과정을 말합니다. 기존의 분석 방법인 GBS(Genotyping by Sequencing), Microarray, PCR은 각각 장점이 있지만, 샘플 수가 많거나 복잡한 유전자 정보 분석에는 한계가 있습니다. 예를 들어, GBS와 Microarray는 대량의 마커 분석에는 유리하지만, GBS는 제한효소 위치에 따라 영향을 받기 때문에 커버리지가 낮을 수 있고, Microarray는 한정된 마커만 분석할 수 있습니다. PCR은 적은 수의 마커를 빠르게 분석할 수 있어 대량의 샘플 처리에 유리하지만, 많은 수의 마커를 분석하는 데는 적합하지 않습니다. 

타겟 시퀀싱은 마커 수를 유연하게 조절할 수 있으며, 분석 대상 영역에 대해 높은 커버리지를 제공하고, 자동화 장비를 이용한 대량의 샘플 처리도 가능하여 기존 기술의 한계를 극복하고 더욱 정밀하고 포괄적인 분석을 수행할 수 있습니다. 셀레믹스의 시약 생산 능력과 커스텀 키트 제조 기술을 바탕으로, 고객이 원하는 동물 및 식물의 분자 육종 마커를 패널로 제작하고 이를 최적화된 시약 세트와 함께 공급할 수 있습니다.
(관련 패널 링크> https://www.celemics.com/ko/products/ready-to-use-ngs-panel/high-throughput-genotyping-panel/)

셀레믹스는 동식물 게놈 분석 패널 외에 다양한 병원체 분석 패널도 제공하고 있습니다. 동물 및 식물 종에서 질병을 일으키는 병원체나 인간과 동물 간에 전파되는 병원체를 타겟 시퀀싱을 통해 효과적으로 검출할 수 있습니다. 검출 대상 병원체의 특성과 검사 환경에 따라 특정 마커부터 전장 유전체까지 분석 대상을 결정할 수 있으며, Hybridization 방식과 PCR Amplicon 방식의 패널을 모두 제작할 수 있습니다. 다양한 유전자 포획 패널의 개발 경험을 바탕으로 기존 분석 방법으로는 포획이 어려웠던 영역에 대해서도 염기서열 분석을 수행하는데 성공하였습니다. 이러한 다양한 분석 방식을 통해, 정확하고 효율적인 병원체 검출 및 분석을 제공하며, 각종 질병 예방과 연구에 기여할 수 있습니다.


(관련 패널 링크: https://www.celemics.com/ko/products/ready-to-use-ngs-panel/african-swine-fever-virus/)