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   차세대 염기서열 분석기술(NGS)는 대량의 염기서열 분석 데이터를 저렴한 비용으로 생산할 수 있는 기술로 다양한 분야에서 활용되고 있습니다. 한 번의 장비 수행에서

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   차세대 염기서열 분석기술(NGS)는 대량의 염기서열 분석 데이터를 저렴한 비용으로 생산할 수 있는 기술로 다양한 분야에서 활용되고 있습니다. 한 번의 장비 수행에서 생산되는 데이터의 양이 워낙 방대하기 때문에 여러 개의 샘플을 동시에 분석할 수 있도록 인덱스 서열을 이용하여 각 샘플의 데이터를 구분하는데 사용합니다. 그러나 일부 시퀀싱 장비에서는 샘플에 추가한 인덱스가 다른 샘플의 인덱스와 뒤바뀌어 데이터가 […]

셀레믹스 NGS Library Preparation Kit의 Workflow 셀레믹스는 NGS를 이용하는 다양한 고객의 편의를 위해 Illumina, MGI, Thermo Fisher(Ion Torrent)사 각각의 시퀀싱 플랫폼에 최적화된 library preparation kit를 제공합니다. 셀레믹스의 Library Preparation Kit는각 시퀀싱 플랫폼별로 두 가지(LP, EP) 방식의 키트로 구성되어 있으며, 이번 블로그 게시글로  LP, EP 키트의  Workflow를 소개하고자 합니다.   NGS Library Preparation(LP) Kit | Workflow […]

생명체의 유전정보를 갖고 있는 게놈(Genome)은 A, T, G, C 염기들의 다양한 조합으로 이루어져 있습니다. 이 염기 서열의 조합 특성에 따라서 실험 및 분석 과정의 정확도가 영향을 받아 분석과 시퀀싱(Sequencing)이 어려워지기도 합니다. 유전자 포획 패널 디자인 과정에서도 이에 대한 고려가 필요한데, 이러한 영역들을 hard-to-capture 영역이라고 부릅니다. Hard-to-capture 영역들이 가지고 있는 특징들은 다음과 같습니다. 1. 반복 서열을 […]

차세대 시퀀싱 기술(Next-Generation Sequencing, NGS)이 상용화되면서 자성 비드(bead)를 이용한 DNA 정제는 생물학 관련 연구자들에게 보편화되고 있습니다. 자성 비드(Magnetid beads)를 이용한 DNA 정제(Purification)는 실험 과정의 단순함, 높은 재현성(Reproducibility) 및 강건성(Robustness),  쉬운 자동화 장비 적용, 효율적인 비용 등과 많은 장점들이 있습니다. 이러한 이유로 NGS를 사용하는 연구자들은 NGS library 제작 과정에서 자성 비드(Magnetid beads)를 적극 활용하고 있습니다. 저희 […]

  암 환자의 진단, 예후 및 치료 계획 수립에 있어 종양 세포의 유전적 특징을 파악하는 일은 매우 중요합니다. 현재 종양 세포에 대해 가장 포괄적인 유전체 정보를 제공할 수 있는 기법은 전장 유전체 시퀀싱(WGS) 및 엑솜 시퀀싱(WES)이지만, 그 대상 영역이 너무 크기 때문에 시퀀싱 및 분석 비용이 높다는 단점이 있습니다. 비용 효율화를 위하여 최근 몇 년간 […]

엑솜(Exome)이란? 엑솜은 인간 게놈 중 단백질 정보를 포함하고 있는 유전자 영역 전체를 의미합니다. 엑솜은 인간 게놈의 약 1.5%를 차지하고 있으며, 나머지 영역은 트랜스포존(transposon), 반복 서열 등의 non-coding DNA로 이루어져 있습니다. Non-coding DNA중 일부는 noncoding RNA나 유전자 발현을 조절하는 영역 등 기능이 알려진 경우도 존재하지만 아직 정확한 역할이 알려지지 않은 영역들이 많습니다. 이와 달리 엑솜은 각 […]