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CancerScreen CDx Panels

Highly optimized somatic cancer NGS panel for Companion Diagnostics

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Overview

CancerScreen CDx 패널

CancerScreen CDx 패널은 Somatic Cancer와 연관 있는 유전자의 유전변이를 정확하게 분석하기 위해 높은 특이도와 민감도를 갖도록 개발된 패널로 비용 효율적인 분석이 가능합니다. 본 패널은 특히 TERT Promoter 영역과 같이 치료를 위한 약물의 효과에 영향을 미치는 것으로 알려진 유전자들에 집중한 패널로 치료제 효과 검증 등이 필요한 경우에 보다 유용한 정보를 얻을 수 있습니다.

분석이 필요한 유전자가 패널에 없는 경우 Gene Add-on 서비스를 통해 추가할 수 있어 더욱 유용하게 사용할 수 있습니다.

셀레믹스에서는 BI 분석 서비스를 제공하고 있습니다. 고객이 원하는 결과의 수준에 따라 1차 (Primary), 2차 (Secondary), 3차 (Tertiary)의 세분화된 다른 분석 결과를 제공하고 있습니다. BI에 익숙하지 않은 고객들도 별도의 세팅 없이 유전 변이 분석 결과를 얻을 수 있습니다

CancerScreen CDx Panels
Features & Benefits

고형암 유전자 분석에 최적화된 패널

패널에 포함된 각 유전자의 Coding Exon뿐만 아니라 FDA 승인 치료 약물의 효과에 영향을 주는 모든 주요 유전 변이를 분석할 수 있습니다. SNV, InDel, Large InDel, CNV, Gene Rearrangements를 포함해 MSI, TMB까지 모든 종류의 유전 변이를 한 번의 검사로 분석할 수 있습니다.

Performance Comparison with Competitor Product

  • Higher on-target ratio, uniformity, coverage at 100X compared to competitor product over the target regions including exons and introns
Performance Comparison with Competitor Product

높은 민감도와 특이도

CancerScreen CDx 패널은 매우 높은 시퀀싱 Depth를 바탕으로 암종에 대한 약물 치료 효과에 중요하다고 알려진 유전 변이들을 정확히 검출할 수 있습니다. 독자적인 프로브 디자인 기술을 바탕으로 GC-rich 영역이나 Homologous 영역에 발생하는 유전 변이뿐만 아니라 FFPE, ctDNA와 같은 손상되거나 미량인 샘플에 대해서도 최상의 민감도와 특이도로 중요한 유전변이들을 놓치지 않고 분석할 수 있습니다.

Raw Data부터 Clinical Interpretation 수준까지 세분화된 BI 분석 서비스 제공

유전변이의 병원성, 약물 연관성을 비롯해 타겟 유전자의 기능 정보 등 세분화된 분석 파이프라인을 갖추고 있어 고객이 원하는 결과의 수준에 맞춰 분석 서비스를 진행해 드립니다.

Bioinformatics and Clinical Report Example

CancerScreen CDx Panels

빠르고 편리한 실험 과정

셀레믹스는 시퀀싱 플랫폼 이외의 다른 장비를 필요로 하지 않는 프로토콜을 제공합니다. 독자적인 시약 개발 기술을 통해 기존 Dry, QC에 필요한 장비를 효소와 마그네틱 비드로 대체할 수 있도록 준비했습니다. 또한 기존 20 시간 이상 걸리던 실험 시간을 8 시간 이내로 끝낼 수 있도록 프로토콜을 최적화해 하루 안에 시퀀싱을 수행할 수 있습니다.

Newly Developed Same-Day Workflow

Conventional
workflow
» 20 hours

Library Prep

Target Capture

Newly Developed Same-Day Workflow

Same-day
workflow
» 5-8 hours

Library Prep

Target Capture

Newly Developed Same-day Workflow

Newly developed same day workflow

Specification

Product Name CancerScreen CDx DNA Kit CancerScreen CDx RNA Kit CancerScreen CDx HRD Kit
Gene count 19 10 15
Target size 48.7 kb 33.0 kb 71.5 kb
Mutation type SNV, Indel, CNV, Rearrangement
Covered region Whole CDS, Rearrangement
Sample Type FFPE, Fresh tissue, etc.
Platform All sequencers from Illumina and Thermo Fisher
Bioinformatics Support ① Primary Analysis: FASTQ to annotated VCF
② Secondary Analysis: CNV, Large InDel, TMB & MSI
③ Tertiary Analysis: Clinical interpretation
Visualization Curation (Heatmap, CNV visualization, Statistical analysis, etc.)

Specification - Gene List

  • 19 genes | Gene count
  • 48.7 kb | Target Size
DNA Panel BRCA1 BRCA2 BRAF EGFR ERBB2 EZH2
FGFR3 FLT3 IDH1 IDH2 KIT KRAS
MET NF1 NRAS PDGFRA PDGFRB PIK3CA
TP53          
  • 10 genes | Gene count
  • 33.0 kb | Target Size
RNA Panel ALK ROS1 RET NTRK1 NTRK2 NTRK3
FGFR2 FGFR3 BCR ABL1    
  • 15 genes | Gene count
  • 71.5 kb | Target Size
HRD Panel ARID1A ATM ATRX BAP1 BLM BRIP1
CHEK2 FANCC MRE11 NBN PALB2 RAD50
WRN BRCA1 BRCA2      

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셀레믹스에서 제공하는 BI 분석 서비스로 다양한 수준의 분석 결과 제공 가능

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Resources

Technical Resources

Flyer_CancerScreen CDx Panel

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Product Overview] Celemics Target Enrichment Panel Overview

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[Catalogue] Celemics Products & Service Catalogue_All Products & Service

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Safety Data Sheets

MSDS_CancerScreen CDx Panels_Illumina_Enzymeplus

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MSDS_CancerScreen CDx Panels_Illumina

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MSDS_CancerScreen CDx Panels_Thermo Fisher

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MSDS_CancerScreen CDx Panels_MGI_EnzymePlus

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MSDS_CancerScreen CDx Panels_MGI

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References

Identification of tissue of origin in cancer of unknown primary using a targeted bisulfite sequencing panel

Epigenomics

Identification of tissue of origin in cancer of unknown primary using a targeted bisulfite sequencing panel

Bae JM, Ahn JY, Lee H, Jang H, Han H, Jeong J, et al. Identification of tissue of origin in cancer of unknown primary using a targeted bisulfite sequencing panel. Epigenomics. 2022 May;14(10):615–28.

 

10.2217/epi-2021-0477


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Germline pathogenic variants in unselected Korean men with prostate cancer

Investig Clin Urol

Germline pathogenic variants in unselected Korean men with prostate cancer

So MK, Ahn HK, Huh J, Kim KH. Germline pathogenic variants in unselected Korean men with prostate cancer. Investig Clin Urol. 2022 May;63(3):294–300.

 

DOI 10.4111/icu.20220044


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Feasibility of targeted cascade genetic testing in the family members of BRCA1/2 gene pathogenic variant/likely pathogenic variant carriers

Scientific Reports

Feasibility of targeted cascade genetic testing in the family members of BRCA1/2 gene pathogenic variant/likely pathogenic variant carriers

Lee J, Ham JY, Park HY, Jung JH, Kim WW, Kang B, et al. Feasibility of targeted cascade genetic testing in the family members of BRCA1/2 gene pathogenic variant/likely pathogenic variant carriers. Sci Rep. 2022 Feb 3;12(1):1842.

 

DOI 10.1038/s41598-022-05931-3


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A novel bi-alleleic DDX41 mutations in B-cell lymphoblastic leukemia: case report

BMC Medical Genomics

A novel bi-alleleic DDX41 mutations in B-cell lymphoblastic leukemia: case report

Shin WY, Yoon SY, Park R, Kim JA, Song HH, Bang HI, et al. A novel bi-alleleic DDX41 mutations in B-cell lymphoblastic leukemia: case report. BMC Med Genomics. 2022 Mar 4;15(1):46.

 

DOI 10.1186/s12920-022-01191-2


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