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NGS Pathogen Analysis Kit
Broad Pathogen Coverage · Streamlined Sample-to-Report Workflow · High Sensitivity in Complex Samples
Overview
병원체 분석 및 모니터링을 위한 NGS 키트 및 생물정보학 분석 플랫폼
셀레믹스(Celemics)는 앰플리콘 기반(amplicon-based)과 하이브리디제이션(hybridization-based) 기반 타겟 농축 기술을 모두 제공할 수 있어 광범위한 병원체 NGS 솔루션이 가능합니다. 셀레믹스의 병원체 NGS 솔루션은 병원체 농도가 낮거나 샘플 복잡도가 높은 경우에도 바이러스, 박테리아, 곰팡이, 기생충 등의 병원체를 신뢰성 있게 검출 및 분석할 수 있습니다. 시료 준비부터 분석 리포트 생성까지 전체 워크플로우는 셀레믹스의 키트, 검증된 프로토콜, 자동화된 분석 파이프라인을 통해 완벽하게 지원됩니다.
Features & Benefits
저품질 현장 샘플에서도 검증된 높은 민감도
셀레믹스의 병원체 패널은 낮은 입력량(low-input) 및 분해된 현장 샘플(degraded field samples)을 사용하여 분석 및 임상적 검증을 완료하였습니다. 병원체 농도가 낮은 어려운 샘플에서도 일관된 높은 유전체 커버리지를 확보하며, 다양한 바이러스 대상에 대해 신뢰성 있는 검출 한계(LOD) 성능을 입증했습니다.
어려운 조건에서도 우수한 유전체 커버리지
(A) 다양한 바이러스 부하 조건에서의 뛰어난 민감도
앰플리콘 기반 패널은 인플루엔자 A/B와 같은 세그먼트 유전체 구조를 가진 바이러스에서도 HA(Segment 4), NA(Segment 6) 등 검출이 어려운 영역까지 포함해 뛰어난 커버리지를 제공합니다.
(B) 낮은 바이러스 부하의 임상 샘플에서도 검출 가능
하이브리디제이션 기반 패널은 변이율이 높은 유전체 영역 및 Ct 32 수준의 저농도 샘플에서도 90% 이상의 유전체 커버리지를 안정적으로 유지하였습니다.
Exceptional Sensitivity Across the Viral Load Spectrum
Influenza A
Influenza B
Influenza A - NA Segment
Celemics
Company I
* 1.2 M reads / sample
A
Respiratory Syndrome Panel
Hemorrhagic Fever Syndrome Panel
B
단일 및 동시 감염에서의 고감도 검출
Celemics 병원체 패널은 단독 감염뿐만 아니라 동시 감염(co-infection) 및 숙주 유전체 오염 샘플에서도 높은 민감도를 유지합니다. 임상 및 환경 샘플 내 단일, 이중, 삼중 병원체 혼합 모델에 대해 모두 90% 이상의 유전체 커버리지를 확인하였습니다.
단독 및 동시 감염 시료에서도 안정적인 높은 유전체 커버리지
(A) 다중 병원체 검출
단일 및 다중 병원체가 포함된 샘플 모두에서 검출 성능을 검증하였으며, 다양한 바이러스 및 박테리아 병원체에 대해 90%이상으로 일관된 유전체 커버리지
(B) Celemics RSV Panel의 커버리지 성능
임상적으로 중요한 다양한 호흡기 병원체에 대해 반복 검증을 통해 확인된 90%이상의 일관된 높은 커버리지
Multiple Pathogen (Co-Infection) of Fever Syndrome Panel
Single Pathogen - Viruses
Single Pathogen - Bacteria
2 pathogens
3 pathogens
A
RSV A
RSV B
* The resulting reads were downsampled to 0.6 million per sample for analysis
B
연구 목적에 따라 선택 가능한 타겟 농축 기술: 앰플리콘 vs 하이브리디제이션(Amplicon or Hybridization)
셀레믹스는 앰플리콘(Amplicon) 및 하이브리디제이션(Hybridization) 기반 타겟 농축 기술을 모두 제공하며, 병원체 특성, 샘플 복잡도, 분석 목적에 따라 최적의 방식을 선택할 수 있습니다. 앰플리콘 방식은 이미 알려진 병원체의 빠르고 비용 효율적인 고처리량 검출에 적합하며, 하이브리디제이션 방식은 넓은 커버리지, 변이 내성, 복잡하고 저품질 샘플에서도 안정적인 성능을 제공합니다.
앰플리콘 vs 하이브리디제이션 기반 농축 기술 비교
아래의 비교를 통해 연구자들은 자신의 연구 목적에 가장 적합한 타겟 농축 기술을 쉽게 선택할 수 있습니다.
| 앰플리콘 기반 | 하이브리디제이션 기반 | |
|---|---|---|
| 주요 특성 | 알려진 타겟 영역의 빠른 증폭 | 새로운 병원체 및 복잡한 시료 분석 가능 |
| 주요 적용 | 변이 분석, 고처리량 검출 | 다양한 병원체 식별, 복합 시료 분석 |
| 민감도 | 매우 높음 (저농도 타겟에 적합) | 높음 (복잡하고 희박한 시료에 적합) |
| 변이 내성 | 낮음 (프라이머 결합부위 변이에 민감) | 매우 높음 (프라이머 비의존적) |
| 유연성 | 제한적 (프리디자인 프라이머 기반) | 매우 유연 (타겟 확장 용이) |
| 소요 시간 | 빠름 (~1일 이내) | 중간 (1~2일) |
| 비용 효율성 | 알려진 타겟에 매우 효율적 | 복잡한 대규모 타겟 분석에 효율적 |
누구나 쉽게 사용할 수 있는
생물정보학 분석 플랫폼
셀레믹스는 사용자가 FASTQ 파일을 업로드하는 것만으로 시퀀싱 품질 평가 및 병원체 및 변이 검출 결과를 시각화된 리포트 형태로 확인할 수 있는 자동화된 분석 솔루션을 제공합니다.
Data
Upload
Automated
Analysis
Visualized
Report
맞춤형 패널 설계 지원
셀레믹스는 연구 목적에 맞춰 유전자, 유전체 영역 또는 병원체 전체를 타겟에 추가할 수 있는 맞춤 설계를 지원합니다. 인수공통감염병 추적, 환경 모니터링, 백신 개발 등 다양한 연구 목적에 따라 패널을 자유롭게 구성할 수 있으며, 미토콘드리아 또는 인트론 영역 삽입도 요청 가능합니다.
Workflow
간단하고 빠른 실험 절차, 별도 장비 불필요
셀레믹스의 키트는 간소화된 실험 프로토콜을 제공하며, 라이브러리 제작 및 타겟 농축에 별도의 특수 장비가 필요하지 않습니다. 장비 보유 여부와 관계없이 다양한 실험 환경에서 손쉽게 도입할 수 있습니다.
1.Sample Input
(DNA/RNA)
3.Sequencing
Compatible with All
Sequencing Platforms
Data Upload &
Automated Bioinformatics Analysis
→ Visualized Report
& Consensus Genome Output
4.Analysis
2-1.Amplicon-based
2-2.Hybridization-based
Target
Amplification
Target
Enrichment
Library
Preparation
Library
Preparation
1.Sample Input
(DNA/RNA)
Hybridization-based
Target
Enrichment
Library
Preparation
Amplicon-based
Library
Preparation
Target
Amplification
Compatible with All
Sequencing Platforms
3.Sequencing
Data Upload &
Automated Bioinformatics Analysis
→ Visualized Report
& Consensus Genome Output
4.Analysis
Specification
Amplicon-based Pathogen Enrichment Kits (Ready-to-use Panel)
| Pathogen | Influenza A/B Virus | Respiratory syncytial Virus A/B | Human Metapnuemovirus A/B |
|---|---|---|---|
| Target Region | Whole genome | Whole genome (>98%) | Whole genome (>98%) |
| Enrichment Method | Multiplex PCR | ||
| Hands-on Time | 2.5 hr (Assay Time 8 hrs) | ||
| Sample Type | Sputum, nasopharyngeal and oropharyngeal swabs and aspirate, tissue samples, and other methods for viral RNA sampling. | ||
| Bioinformatics Pipeline |
FASTQ to VCF Consensus genome sequence Analysis report | ||
Hybridization-based Pathogen Enrichment Kits (Ready-to-use Panel)
Comprehensive Respiratory Virus Panel
| Target Viruses* | 9 types / 39 virus strains, including SARS-CoV-2 |
|---|---|
| Target Size | 706 Kb |
| Mutation Analysis | Variant detection, Viral mutation (SNV, Indel) from generated Whole Genome Sequence |
| Sample Type | URT, NP/OP, etc. |
| Platform | All Illumina and Thermo Fisher Scientific Sequencers |
| Kit Composition | Provides all required reagents, including RNA to cDNA kit, cDNA to captured library kit, and bioinformatics SW |
| Bioinformatics Pipeline | Stand-alone bioinformatics SW 'Celemics Virus Verifier' (FASTQ to Visual Report) |
African Swine Fever Virus Panel
| Target Viruses* | ASFV 26 strains |
|---|---|
| Target Size | 192 kb |
| Mutation Type | Virus detection, Virus genome assembly |
| Sample Type (amount) | Swine Blood (> 50 ng of fragmented DNA) |
| Platform | All sequencers from Illumina, Thermo Fisher, MGI, PacBio, and Oxford Nanopore |
| Bioinformatics Support | Celemics Virus Verifier (Detection report) |
Related Products
Library Preparation Kit
Highly optimized, user- convenient NGS library preparation kit for all Celemics panels
CeleMag Clean-up Bead
Incomparable quality magnetic bead for simple, flexible, and reproducible purification
Comprehensive Respiratory
Respiratory Virus Comprehensive analysis of 9 different virus types, 39 strains of clinically significant respiratory viruses
African Swine Fever Virus Panel
Virus Accurate identification of various ASFV strains in a single NGS reaction with species-specific blocker
NGS Library Preparation 키트로 셀레믹스의 Target Enrichment 패널에 최적화된 키트
최고 품질의 마그네틱 비드로 사용하기 편리하며 높은 재현성을 보여 NGS 실험에 최적화된 비드
임상 진단을 위한 9가지의 다른 바이러스형 확인과 39가지의 균주 확인이 가능한 패널
한번의 테스트로 다양한 ASFV 균주의 정확한 확인이 가능한 패널
Resources
Technical Resources