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Methylation Sequencing Panel
Facilitate Epigenetics research with Celemics’ NGS solution
Overview
Methylation Sequencing
Methylation 시퀀싱은 유전체 전반적으로 또는 타겟 영역의 메틸화된 DNA의 위치와 수준을 식별하기 위한 방법으로 후성유전학 연구에서 주로 사용하는 시퀀싱 방법입니다. 셀레믹스의 Methylation 시퀀싱 솔루션은 유전체 전체 또는 특정 타겟 영역의 Methylation 패턴을 더 포괄적이고 상세히 제공할 수 있습니다.
Standard Workflow of Targeted Methyl-seq
Standard Workflow of Targeted Methyl-seq
DNA
Sample
Methylated
adaptor
On-bead
conversion
protocol
Index PCR
Post-PCR
Library
Preparation
Bisulfite
Conversion
Target
Enrichment
Sequencing
Targeted
Methyl-seq Data
Standard Workflow of Targeted Methyl-seq
Celemics Proprietary Probe Design for Methyl-seq
“G/A” panel
“C/T” panel
Pre-PCR
Bisulfite
conversion
Celemics Proprietary Probe Design for Methyl-seq
Celemics Proprietary Probe Design for Methyl-seq
Features & Benefits
Methyl-seq을 위해 특별히 고안된 프로브 사용
셀레믹스에서는 Bisulfite Conversion에 의한 시퀀스 변화를 고려하여 디자인한 프로브를 제공합니다. 이를 통해 Bisulfite Conversion 전후 시퀀스의 비교 분석을 수행하여 메틸화 부위를 정확하게 감지할 수 있습니다.
BI analysis for methylation sequencing
Alignment
FASTQ Filter
Methylation
Extractor
Visualization
Methylation
Pattern
Deduplication
Raw
Data
Bismark
Standard Analysis Pipeline Targeted Methyl-seq
BI analysis for methylation sequencing
다양한 샘플 타입, C/T Conversion 방법과 호환
셀레믹스의 메틸-시퀀싱 솔루션은 독자적인 프로브와 워크플로우를 사용하여 gDNA 및 cfDNA를 포함한 다양한 샘플에서 메틸화 분석을 수행할 수 있습니다.
효소 및 화학 처리를 통한 두 가지 C/T Conversion 방법 모두에 적용 가능하며 두 방법 사이에 시퀀싱 데이터에 차이가 나지 않는 최고 품질의 패널을 공급합니다.
High Reproducibilty of Methylation Pattern Analysis
The results demonstrate high reproducibility of the analysis, yielding the same methylation patterns when repeatedly tested with the identical specimens.
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Resources
Technical Resources
Safety Data Sheets
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MSDS_Methylation Sequencing Panel_Illumina
MSDS_Methylation Sequencing Panel_Thermo Fisher
MSDS_Methylation Sequencing Panel_MGI
References
Cancers
Discovery and Validation of Survival-Specific Genes in Papillary Renal Cell Carcinoma Using a Customized Next-Generation Sequencing Gene Panel
Hwang J, Bang S, Choi MH, Hong SH, Kim SW, Lee HE, Yang JH, Park US, Choi YJ. Discovery and Validation of Survival-Specific Genes in Papillary Renal Cell Carcinoma Using a Customized Next-Generation Sequencing Gene Panel. Cancers. 2024 Jan;16(11):2006.
10.3390/cancers16112006
Frontiers in Neurology
Case report: Compound heterozygous variants detected by next-generation sequencing in a Tunisian child with ataxia-telangiectasia
Ammous-Boukhris N, Abdelmaksoud-Dammak R, Ben Ayed-Guerfali D, Guidara S, Jallouli O, Kamoun H, Charfi Triki C, Mokdad-Gargouri R. Case report: Compound heterozygous variants detected by next-generation sequencing in a Tunisian child with ataxia-telangiectasia. Frontiers in Neurology. 2024 May 31;15:1344018.
10.3389/fneur.2024.1344018
Scientific Reports
Sex-specific survival gene mutations are discovered as clinical predictors of clear cell renal cell carcinoma
Hwang J, Lee HE, Han JS, Choi MH, Hong SH, Kim SW, Yang JH, Park U, Jung ES, Choi YJ. Sex-specific survival gene mutations are discovered as clinical predictors of clear cell renal cell carcinoma. Scientific Reports. 2024 Jul 9;14(1):15800.
10.1038/s41598-024-66525-9