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Metagenomic Sequencing Panel
Detection of Bacterial Pathogen and Microbe Classification
Overview
Metagenomic Sequencing
셀레믹스의 Metagenomic 시퀀싱 패널을 통해 미생물 군집에 어떤 미생물이 포함되어 있는지 분석할 수 있습니다.
세균 및 고세균의 16S V4 (또는 V3-V4) 영역 및 곰팡이류의 18S ITS1 (또는 ITS1-ITS2) 영역을 PCR로 증폭하고, CeleMag 비드를 사용하여 정제 후 NGS를 수행합니다. 독자적으로 개발한 분석 파이프라인을 통해 다양한 분석 보고서를 작성하여 제공합니다.
※ 셀레믹스의 Metagenomic Sequencing은 대량 주문(최소 3,840 rxns)에 한하여 제공됩니다. 관련된 문의 사항은 Contact Us를 통해 연락 주시면 상세한 답변을 드리겠습니다.
Features & Benefits
유연한 패널 디자인
셀레믹스는 Ready-to-use 패널과 고객 맞춤형 패널 디자인 옵션을 통해 고객의 목적에 가장 적합한 패널을 제공합니다. 세균과 곰팡이류의 V3-V4 영역 시퀀싱을 위한 패널 및 ITS1 영역을 시퀀싱 할 수 있는 Ready-to-use 패널을 제공하고 있습니다. 추가로 필요한 시퀀싱 영역이 있을 경우 옵션을 통해 원하는 유전자 영역을 추가할 수 있습니다.
16S rRNA sequencing for bacteria
18S ITS sequencing for fungi
미생물 종의 분류 및 다양성에 대한 독자적인 BI 분석 서비스
독자적으로 개발한 BI 분석 파이프라인을 통해 미생물 분류 계통 및 다양성을 포함한 다양한 종류의 분석을 지원합니다. 종합적인 분석 결과를 통해 샘플 미생물 군의 전체적인 모습에 대한 정보를 쉽게 알 수 있습니다.
Example of metagenomic sequencing analysis report
Results presented above are a few selected examples of the metagenomics sequencing results that Celemics provides. Contact us for more information.
Taxonomy analysis
Alpha rarefaction
Alpha diversity
Beta diversity
Workflow
NGS-based metagenomic analysis workflow
- By Celemics’ BI analysis pipeline, various types of analysis for the microbes are supported including taxonomy classification and diversity.
Raw Sequences
Representative
sequences
Taxonomy
classification
Diversity analyses
Feature table
Denoising
Raw Sequences
Denoising
Representative
sequences
Feature table
Taxonomy
classification
Diversity
analyses
Related Products
Library Preparation Kit
NGS Library prep 키트로 셀레믹스의 Target Enrichment 패널에 최적화된 키트
CAS
셀레믹스에서 제공하는 BI 분석 서비스로 다양한 수준의 분석 결과 제공 가능
CeleMag Clean-up Bead
최고고 품질의 마그네틱 비드로 사용하기 편리하며 높은 재현성을 보여 NGS 실험에 최적화된 비드
CLM Polymerase
PCR 반응에 필요한 모든 구성요소를 포함하고 있는 믹스 제품이며 NGS에서 요구하는 정확도를 충족한 제품
NGS Library prep 키트로 셀레믹스의 Target Enrichment 패널에 최적화된 키트
셀레믹스에서 제공하는 BI 분석 서비스로 다양한 수준의 분석 결과 제공 가능
최고고 품질의 마그네틱 비드로 사용하기 편리하며 높은 재현성을 보여 NGS 실험에 최적화된 비드
Resources
Technical Resources
Safety Data Sheets
최신 MSDS 파일이 필요하시면 ‘Contact Us‘를 통해 문의 주시기 바랍니다.
MSDS_Metagenomic Sequencing_Illumina
MSDS_Metagenomic Sequencing_Thermo Fisher
MSDS_Metagenomic Sequencing_MGI
References
PeerJ
The role of microbiomes in cooperative detoxification mechanisms of arsenate reduction and arsenic methylation in surface agricultural soil
Rueangmongkolrat, N., Uthaipaisanwong, P., Kusonmano, K., Pruksangkul, S., & Sonthiphand, P. (2024). The role of microbiomes in cooperative detoxification mechanisms of arsenate reduction and arsenic methylation in surface agricultural soil. PeerJ, 12, e18383.
10.7717/peerj.18383
PeerJ
Characterization of the complete mitochondrial genome of the Sunda stink-badger (Mydaus javanensis) from the island of Borneo
Subbiah, V. K., Gomez, C. R., Robben, D. M., Subramaniam, R., & Hearn, A. J. (2024). Characterization of the complete mitochondrial genome of the Sunda stink-badger (Mydaus javanensis) from the island of Borneo. PeerJ, 12, e18190.
10.7717/peerj.18190
Heliyon
Diversity, astaxanthin production, and genomic analysis of Rhodotorula paludigena SP9-15
Phuengjayaem S, Kingkaew E, Hoondee P, Rojsitthisak P, Sritularak B, Thitikornpong W, et al. Diversity, astaxanthin production, and genomic analysis of Rhodotorula paludigena SP9-15. Heliyon. 2023;9(7):e18280.
10.1016/j.heliyon.2023.e18280
Toxins
Intraspecific Diversity and Pathogenicity of Bacillus thuringiensis Isolates from an Emetic Illness
Pheepakpraw J, Kaewkod T, Konkit M, Krongdang S, Jantakee K, Praphruet R, et al. Intraspecific diversity and pathogenicity of Bacillus thuringiensis isolates from an emetic illness. Toxins (Basel). 2023;15(2):89.
10.3390/toxins15020089