Library Preparation Kit
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Optimized for high-efficiency Celemics Panels (Standard / EP)
Incomparable quality magnetic bead for simple, flexible, and reproducible purification
Overview
NGS Library Preparation Kit
셀레믹스의 라이브러리 제작 키트(Library Preparation Kit)는 셀레믹스의 모든 패널에서 높은 효율로 NGS 라이브러리 제작이 가능하도록 최적화되어 있습니다.
Mechanical Fragmentation 방식을 사용하는 Standard Library Prep Kit (LP Kit)와 효소 기반의 Enzymatic Prep Kit (EP Kit)는 End-Repair/A-tailing 효소 믹스, 인덱스 프라이머(싱글 또는 듀얼), 어댑터, 버퍼 등 라이브러리 제작에 필요한 모든 시약을 포함하고 있어 사용자의 워크플로우를 간소화합니다.
셀레믹스는 연구기관, 병원, 진단 기업이 하나의 공급원을 통해 높은 라이브러리 수율, 우수한 재현성, 그리고 안정적인 시퀀싱 결과까지 얻을 수 있도록 지원합니다.
Workflow
NGS Target Enrichment를 위한 Library Preparation 워크플로우
Standard Kit(Mechanical Fragmentation, LP Kit)은 일반적인 워크플로우를 따르며, 기계적(초음파 분해) 또는 효소적(fragmentase) 절단 후 End-repair, A-tailing, 어댑터 라이게이션, 인덱싱 PCR 단계를 거칩니다.
반면, EP Kit(Enzymatic Fragmentation)는 DNA 절단 과정을 End-repair/A-tailing 단계에 통합하여 별도의 절단 과정이 필요하지 않습니다.
이러한 유연성 덕분에 사용자는 실험실 환경에 따라 기존의 절단 장비를 활용하거나, 보다 단순화된 EP 프로토콜을 선택할 수 있습니다.
Library Preparation Workflow
For Option 1, ultra sonicator is not provided with the kit.
For Option 2, the inclusion of the fragmentase in the kit is optional.
NGS Library Preparation | ||
|---|---|---|
Standard Fragmentation | EP Fragmentation | |
| Option 1. Sonication | Option 2. Fragmentase | FER / A |
| Bead Purification & Quantification | ||
| ER / A | ER / A | |
| Adapter Ligation (Single / Dual Index) | ||
| Bead Purification | ||
| Index PCR | ||
Target Enrichment | ||
Features & Benefits
높은 수율과 뛰어난 재현성
셀레믹스의 라이브러리 제작 키트(Library Preparation Kit)는 최대 DNA 라이브러리 수율과 일관된 결과를 얻을 수 있도록 설계되었습니다. 비교 평가 결과, Standard Kit과 EP Kit 모두 높은 라이브러리 수율과 뛰어난 재현성을 보여주었습니다.
Library Yield Reproducibility of LP and EP Kits
Five replicate libraries were prepared using 100 ng of input DNA to evaluate the reproducibility and yield performance of the Celemics LP and EP Kits. The LP Kit was tested with 8 PCR cycles and the EP Kit with 5 PCR cycles under identical conditions.
Both kits demonstrated consistent library yields across replicates, confirming high reproducibility, while the EP Kit showed higher overall yield efficiency.More uniform read depths over GC-rich regions compared to competitor products.
고·저 GC 영역에서도 균일한 증폭 성능
셀레믹스의 라이브러리 제작 키트는 폭넓은 GC 함량 범위에서 안정적인 증폭 성능을 제공합니다.
셀레믹스의 독자적인 CLM Polymerase가 적용되어, GC가 풍부하거나 부족한 유전체 영역 모두에서 우수한 증폭 균일성을 유지하고 PCR 편향을 최소화합니다.
서로 다른 GC 조성을 가진 세균 유전체를 대상으로 한 비교 연구에서도 CLM Polymerase는 일정하고 균형 잡힌 리드 커버리지를 보여주어, 염기 조성에 관계없이 고품질의 시퀀싱 데이터를 확보할 수 있음을 입증했습니다.
Amplification of high-GC and low-GC regions using CLM Polymerase (EP Kit)
The amplification capacity was tested using bacterial samples with known GC contents. The results show that CLM Polymerase allows steady and uniform amplification without PCR bias for both high-GC and low-GC regions.
* For GC-ratio analysis, the genomic DNA sequence was partitioned into contiguous 200 bp fragments. The GC content of each fragment was computed, and the resulting values were aggregated into a histogram with 2% interval bins. The green, red, and purple lines represent the normalized sequencing depth across different GC-ratio regions.
모든 시퀀싱 플랫폼과의
폭넓은 호환성
셀레믹스의 LP 및 EP Kit은 플랫폼에 구애받지 않으며, 주요 NGS 장비 전반에서 검증되었습니다.
이 키트들은 Illumina, MGI 시퀀싱 플랫폼은 물론 Thermo Fisher의 Ion Torrent 시퀀서와도 완벽히 호환되도록 설계되어, 기존의 시퀀싱 환경이나 분석 파이프라인을 변경할 필요가 없습니다.
또한 셀레믹스의 Target Enrichment Panel과 함께 사용하면, 시료 준비부터 시퀀싱까지 완전히 최적화된 엔드-투-엔드(End-to-End) 워크플로우를 구현할 수 있습니다.
올인원 구성과 자동화 친화적 설계
셀레믹스는 라이브러리 제작에 필요한 모든 구성품을 하나의 키트에 제공합니다.
추가 시약을 별도로 준비할 필요가 없어 프로토콜 설정이 간편하며, 인덱싱 프라이머는 싱글 및 듀얼 인덱스 형식으로 제공되어 다양한 처리량과 멀티플렉싱 요구를 충족합니다.
워크플로우는 완전히 자동화에 대응하도록 설계되어, Hamilton, Tecan, Beckman 등 일반적인 액체 취급 로봇 시스템에서도 구현할 수 있습니다. 이를 통해 고처리량의 자동화 프로세스를 실현할 수 있으며, 인력과 시간을 절약하면서도 높은 일관성을 유지할 수 있습니다.
이러한 올인원 및 자동화 친화적 설계는 소규모 연구실은 물론 대형 임상기관 및 코어 시설에도 이상적인 솔루션입니다
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