Overview
셀레믹스 BI 분석 솔루션
NGS 기반의 분자 진단 기술은 빠른 속도로 발전하고 있습니다. NGS 기반의 분자 진단 기술은 실험적 측면의 기술 발전과 데이터를 분석하는 기술의 발전이 같이 이루어져야 전반적인 발전을 이룰 수 있으나, 현재는 발전 속도에 다소의 차이가 있습니다.
실험 기술의 발전에 따라 다양한 새로운 바이오마커가 빠른 속도로 발굴되고 있으나 분석적 측면에서는 고객의 요구에 즉시 대응할 수 있는 솔루션이 거의 없습니다. 셀레믹스의 Celemics Analysis Service (CAS)은 복잡하고 제한적인 시장에서 고객 맞춤형 서비스를 제공하기 위해 개발된 혁신적인 생물 정보학 솔루션입니다. 실시간 고객 소통, 고객 요구에 따른 맞춤형 생물 정보학 분석 결과를 제공합니다.
Features & Benefits
빠르고 정확한 BI 분석 솔루션
CAS는 고객이 생물 정보학 분석에 대한 지식이 없더라도 분석 결과를 얻을 수 있도록 준비되어 있습니다. 고객의 실험 목적과 조건, 샘플의 상태에 따라 적합한 분석 방법을 제공할 수 있습니다 (Germline, Somatic, FFPE, cfDNA, RNA, 바이러스, 박테리아, Non-human Application, De-novo 시퀀싱, 메틸화 시퀀싱 등).
자동화된 BI 분석 파이프라인을 통한 분석을 포함해 비표준 분석에 이르기까지 모든 분석 과정과 결과는 셀레믹스의 BI 분석 전문가가 모니터링합니다. 분석 과정에 문제가 있을 경우 실시간 지원을 통해 고객 요구사항을 충족하기 위해 노력합니다.
셀레믹스는 GATK Best Practice 파이프라인을 따르며, 유럽 기반 서버를 사용하여 GDPR 기준을 만족합니다.
Accurate Clinical Interpretation: Strand Clinical Report
고객 맞춤형 데이터 분석 지원
CAS는 고객의 연구 주제와 목적에 따라 최적화된 분석 서비스를 제공합니다.
고객 요청에 따라 결과 데이터 재분석 및 시각화 정보를 제공할 수 있으며, 고객 요청에 따라 별도의 다른 데이터베이스 정보를 주석으로 활용하는 옵션을 제공할 수 있습니다 (데이터베이스 정보에 대한 사전 사용 승인이 필요할 수 있습니다.)
셀레믹스의 BI 분석 전문가들은 고객과의 긴밀한 소통을 기반으로 표준 파이프라인 외에도 별도의 분석 파이프라인을 개발하는 것을 지원합니다.
Tertiary Analysis - Client-specific Visualization: OncoRisk CNV Analysis
Tertiary Analysis - Client-specific Visualization Curation:
FLT3-ITD Analysis:
visualized by IGV View
Gene Fusion Analysis from FFPE samples
고객 사용 편의성
NGS 데이터 분석에서 발생하는 어려움을 이해하고 있기 때문에, 셀레믹스의 분석 서비스 (CAS)는 무엇보다도 사용자 편의성을 높이는데 주력했습니다.
간단한 데이터 입력 인터페이스를 사용하여 고객별 맞춤 분석이 가능하도록 구성했기에 초기 세팅 비용 및 사용자 교육 시간을 절약할 수 있습니다. 고객의 분석 과정과 결과를 지속적으로 모니터링하여 문제 발생 시 실시간으로 해결할 수 있도록 지원하며 고객의 연구 상황에 따라 권장 분석법을 제공합니다.
Index Hopping과 같은 문제에 대해 지속적으로 모니터링하여 대안을 제공하며, 유럽 지역 내 서버를 사용하여 빠른 데이터 전송 속도와 짧은 전송 간격을 확보했습니다.
Secondary Analysis : CAS Visualized Report
Other Features
비용 효율적인 서비스
BI 분석 전문가가 분석을 도와드립니다. 계정 등록, 셋업 등의 별도의 과정이나 비용을 요구하지 않습니다.
고객 니즈에 맞춰 다른 분석 수준의 결과 제공
고객이 원하는 분석 수준에 맞춰 결과를 제공합니다. 1차 (Primary), 2차 (Secondary), 3차 (Tertiary)의 세 단계로 나뉘며 Raw Data부터 Clinical Interpretation 리포트에 이르기까지 다양한 수준의 결과가 준비되어 있습니다.
셀레믹스는 유전변이에 대한 주석을 제공합니다. 유전자의 기능에 대한 연관성은 물론 진단, 예후 및 치료 계획과 관련이 있는지를 확인할 수 있습니다. 진단 및 예후와 관련한 자료는 AMP (미국 분자병리학회) 임상 지침과 연계한 자료를 제공합니다.
셀레믹스 패널과의 높은 상호 운용성
셀레믹스의 패널의 데이터 분석에 최적화되어 있습니다. 요청에 따라 사용자 친화적인 BI 분석 결과를 제공합니다.
Workflow
01. Analysis Request
[Primary Analysis]
FASTQ to annotated VCF
[Secondary Analysis]
CNV, Large InDel, Fusion, TMB & MSI
[Tertiary Analysis]
Clinical Interpretation
[Provision of client]
Requested reports such as BAM/BAI, Annotated VCF, Performance Summary Statistics, Clinical Reports, etc.
Will require prior consultation and agreement.
[Variant Filtration]
Provision of process report for mutation detection using metrics such as VAF, depth, and strand conditions.
[Variant Clinical Significance]
Gathering relevant data types based on clinical information such as mutation type, protein functions, clinical database, etc.
After confirming the analysis request, a Celemics Bl expert will initiate and monitor the analysis
[Data upload]
On-site server or cloud server
[single click, automated upload]
05. Result Guidance
04. Request Interpretaion
03. BI Analysis
02. Data Transmission
Customer
CELEMICS
Customer
Workflow
[Primary Analysis]
FASTQ to annotated VCF
[Secondary Analysis]
CNV, Large InDel, Fusion, TMB & MSI
[Tertiary Analysis]
Clinical Interpretation
[Data upload]
On-site server or cloud server
[single click, automated upload]
After confirming the analysis request, a Celemics Bl expert will initiate and monitor the analysis
[Variant Filtration]
Provision of process report for mutation detection using metrics such as VAF, depth, and strand conditions.
[Variant Clinical Significance]
Gathering relevant data types based on clinical information such as mutation type, protein functions, clinical database, etc.
[Provision of client]
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Will require prior consultation and agreement.
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